چکیده
زمينه مطالعاتي نقشه يابي ارتباطي اخيراً توجه زيادي را براي مطالعه ژنتيكي صفات كمي در بسياري از گونه های آبزیان مهم به خود جلب كرده است. دسترسي به فناوريهاي نسل جديد توالي يابي، حجم بالاي داده هاي فنوتيپي و تنوع زياد ابزارهاي آماري موجب شده است كه مطالعات نقشه يابي ارتباطي در آبزیان بتواند موفقيتهاي فراواني را در شناسايي مكانهاي ژني كنترل كننده صفات كمي به همراه داشته باشد. با توجه به اهمیت این روش در مطالعات نقشه یابی صفات کمی، پروژه حاضر انجام شد که هدف از آن، توضیح روش نقشه یابی ارتباطی و استفاده از آن در بهنژادی قزل آلای رنگین کمان و سپس انجام متاآلیز QTL (MQTL) برای شناسائی نواحی از ژنوم قزل آلای رنگین کمان که با صفت کمی رشد پیوستگی داشته باشند، بود. به منظور شناسايي جايگاه هاي صفات کمي داده های QTL از بیش از 1400 QTL ثبت شده در بانک پایگاههای اطلاعاتی برای ماهي قزل آلاي رنگين كمان مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. همچنین، برخی از اطلاعات مربوط به نرم افزارهای آماری مورد استفاده در نقشه یابی ارتباطی ارائه و پس از آن در مورد فرصت ها و چالش های نقشه یابی ارتباطی و مطالعات پسا نقشه یابی در سطح کل ژنوم مورد بحث قرار گرفت. برای نقشه های جایگاههای صفات کمی مرتبط با یک نشانگر، توالی نوکلئوتیدی نشانگر مولکولی از پایگاههای اطلاعاتی مربوطه استخراج شدند و علاوه بر این برای نقشه های جایگاههای صفات کمی مرتبط با دو نشانگر مجاور، توالی نوکلئوتیدی هر دو نشانگر مجاور یکدیگر بدست آمدند. مکان یابی هر QTL بر اساس نقشه ژنتیکی و بر اساس سطح اطمینان 95 درصد برای هر جایگاه صفت کمی مورد بررسی قرار گرفت. بعد از مکان یابی هر QTL نرم افزار Biomercator برای پیش بینی مکان و سطح اطمینان MQTL بر اساس روش حداکثر احتمال محاسبه شد. در مجموع 280 QTL برای صفت طول رشد روزانه (ADG)، 16 برای صفت وزن بدن (BW)، 9 مورد برای صفت ضریب چاقی (CF) و 7 QTL برای صفت طول چنگالی (FL) دسته بندی شده اند. در مجموع 27 QTL در چهار گروه پیوستگی برای صفات مورد مطالعه شناسایی شد که از 2 تا 8/۲3 درصد از تغییرات فنوتیپی (LOD) را توجیه مینمودند. بیشترین تعداد QTL شناسایی شده در گروه پیوستگی 13 قرار دارند. در این مطالعه برای صفت ارتفاع بدن QTL شناسایی نگردید. نتایج نشان داد که QTL هاي هم مکان برای صفات مورد مطالعه وجود دارد که وجود چنین حالتی می تواند باعث افزایش کارایی انتخاب به کمک نشانگر و پیشبرد برنامههاي به نژادی در قزل آلای رنگین کمان گردد.