دوشنبه 29 آبان 1402

شناسایی مولکولی دوکفه‌ای بومی تالاب انزلی (آنودونت) با استفاده از توالی یابی ژن سیتوکروم اکسیداز (COI)

کد مصوب: 960399-004-12-32-24؛ محل اجرا: پژوهشکده آبزی‌پروری آبهای داخلی؛ مجری: تورج سهرابی لنگرودی
وضعیت اجرا شده | زیست فناوری و فرآوری آبزیان | بازدید: 227 مرتبه | 0 نظر
چکیده
هدف از  مطالعه حاضر  شناسايي دقيق گونه اي از صدف دو کفه اي بومي تالاب انزلي موسوم به Anodonta cygnea  با استفاده از روش مولکولي توالي يابي و بر اساس بخشي از ژن COI  (سيتوکروم اکسيداز وان) ميتوکندريايي و ثبت آن در بانک ژن جهاني مي باشد. بدين منظور پس از نمونه برداري صدف از تالاب انزلي، نمونه ها به آزمايشگاه ژنتيک منتقل شدند و استخراج DNA از بافت تازه آنها انجام شد.  کيفيت و کميت DNA هاي استخراج شده با  استفاده ازروش های الکتروفورز ژل آگارز 1 درصد و اسپکتروفتومتري در طول موج هاي 260 و 280 نانومتر ارزیابی شد. جهت انجام PCR ابتدا يک قطعه از ژن COI ناحيه ميتوکندريايي از بانک ژن NCBI انتخاب و پس از طراحي يک قطعه با اندازه مناسب توسط نرم افزار GeneRunner سنتز گردید. پس از انجام PCR و اطمينان از تکثير ژن مورد نظر، نمونه هاي تکثير شده توالي يابي شدند. نمونه هاي توالي يابي شده با استفاده از نرم افزارهاي ژنتيکي نظير Mega6 و Chromas تجزيه تحليل شده و پس از بلاست (Blast) بعنوان يک گونه بومي شناسايي شده تالاب انزلي در بانک ژن جهاني NCBI ثبت شدند. با توجه به نتایج بدست آمده از توالی های ژن COI و تطبیق نمونه های موجود با توالی های ثبت شده در بانک ژن مشخص گردید که تمامی نمونه ها متعلق به گونه Anodonta anatine بوده است در حالی که  طی دهه های گذشته با توجه به شباهت بسیار زیاد صدف های دوکفه ای آنودونت به یکدیگر و فقدان روش های نوین ژنتیک مولکولی صدف دو کفه ای تلاب انزلی به اشتباه Anodonta cygnea اطلاق گردیده است.
گزارش پروژه
مشخصات پیمانکار
مشخصات همکاران
اهداف طرح
زمانبندی طرح
روش تحقیق و اجرا
اطلاعات جغرافیایی
هزینه های اجرای پروژه
نتایج